К названию иконы Пресвятой Богородицы «Знамение», празднование в честь которой 27 ноября /10 декабря установил свт. Иоанн-Илия, близко по значению слово «чудо». (См. напр.: Дьяченко Г., прот. Полный церковнославянский словарь.
Об установлении празднования см., напр., в кратком житии святителя: Мануил (Лемешевский), митр.Иоанн, святитель, архиепископ Новгородский и Псковский (Иван, в малой схиме Илия, в схиме Иоанн).

Из вопросов будущего свт. Иоанна-Илии и ответов, которые ему давал свт. Нифонт, видно, что Иоанн в то время был священником или священноиноком. (См.: Вопросы Кирика, Саввы и Илии с ответами Нифонта, епископа новгородского и других иерархических лиц. Ильино. Вопросы 2, 3, 6, 8, 10 и др.
О том, что свт. Иоанн-Илия был новгородцем, см., напр., в кратком житии его: Мануил (Лемешевский), митр. Иоанн, святитель, архиепископ Новгородский и Псковский (Иван, в малой схиме Илия, в схиме Иоанн).

О названных событиях жития свт. Нифонта и жития свт. Иоанна-Илии см.: краткие жития их: Мануил (Лемешевский), митр. Иоанн, святитель, архиепископ Новгородский и Псковский (Иван, в малой схиме Илия, в схиме Иоанн).
Он же. Нифонт, святитель, епископ Новгородский. А также в Киево-Печерском патерике: Поселянин Е. Патерик Печерский, или Отечник. Житие преподобного отца нашего Нифонта.

Имя Печерского игумена, при котором в Киево-Печерском монастыре подвизался будущий свт. Нифонт, см., напр., в Киево-Печерском патерике: Поселянин Е. Патерик Печерский, или Отечник. Житие преподобного отца нашего Нифонта.
Время игуменства прп. Тимофея см.: Толстой М.В., граф. Книга глаголемая «Описание о российских святых, где и в котором граде или области или монастыре и пустыни поживе и чудеса сотвори, всякого чина святых». Преподобный Тимофей игумен, преставися в лето 6639.

Мощи свт. Нифонта после его кончины были положены в Дальних (Феодосиевых) пещерах, впоследствии же были перенесены в Ближние (Антониевы) пещеры. См. об этом: Киево-Печерский патерик: Поселянин Е. Патерик Печерский, или Отечник. Житие преподобного отца нашего Нифонта.
Толстой М.В., граф. Книга глаголемая «Описание о российских святых, где и в котором граде или области или монастыре и пустыни поживе и чудеса сотвори, всякого чина святых». Святый Нифонт епископ Новгородский.
Краткое житие свт. Нифонта в Минее: Минея. Апрель. Ч. 1. – М., 2002. В 8 день.

Об архиепископстве святителя Иоанна-Илии см. напр.: Голубинский Е.Е. История Русской Церкви. Т. 1. Ч. 1.
А также: Мануил (Лемешевский), митр. Иоанн, святитель, архиепископ Новгородский и Псковский (Иван, в малой схиме Илия, в схиме Иоанн).
Об архиепископстве Новгородских владык в период до учреждения Патриаршества на Руси см. напр.: Амвросий (Орнатский), еп. История Российской иерархии. Часть 1.

Во Пскове при впадении Мирожи в Великую свт. Нифонтом был построен храм Преображения Господня и устроен монастырь. Об этом см.: Мануил (Лемешевский), митр. Нифонт, святитель, епископ Новгородский.
Амвросий (Орнатский), еп. История Российской иерархии. Часть 5.

«Вопрошание» Кириково, обращённое, в частности, к свт. Нифонту как к авторитетному лицу, упоминает также и всех остальных перечисленных лиц в качестве тех, к кому в первые века бытия Русской Церкви обращались за разрешением сложных вопросов духовной жизни. (См.: Вопросы Кирика, Саввы и Илии с ответами Нифонта, епископа новгородского и других иерархических лиц. Вопросы Кирика 30, 38, 57, 101; Саввы 4.)
О прп. Феодосии, митр. Георгии, митр. Клименте, упоминаемых в Вопрошании Кирикове в качестве авторитетных лиц, к которым обращались за советом, см. также в Истории митр. Макария:
Макарий (Булгаков), митр. История Русской Церкви. Ч. 2. Гл. 3.; Там же: прим. 1380;
Ч. 2. Гл. 5.

Паломничества по обету в Иерусалим настолько сильно распространились на Руси во времена свт. Нифонта, что иерархи стали накладывать епитимии на тех, кто давал обет идти в Иерусалим. Об этом, а также о том, чем аргументировались эти прещения со стороны иерархии, см.:
Вопрос Кирика 12 (Вопросы Кирика, Саввы и Илии с ответами Нифонта, епископа новгородского и других иерархических лиц.)
Ответ свт. Нифонта о том, что нужно накладывать епитимию на дающих такие обеты, см.: Вопросы Кирика, Саввы и Илии с ответами Нифонта, епископа новгородского и других иерархических лиц. Ильино. Вопрос 22.
Также об этом см., напр., в Истории Соловьёва: Соловьёв С.М. История России с древнейших времён. Т. 3. Гл. 1.

Древнерусские авторы сохранили имя отца свт. Иоанна-Илии, богатого и благочестивого новгородского боярина Николая. Оставленные им средства свт. Иоанн вместе со своим братом использовали для строительства в Новгороде каменных храмов.

Свт. Иоанн-Илия с братом в 1170 году построили на собственные средства монастырь на озере Мячине, а в 1179 году воздвигли в этом монастыре каменную церковь Благовещения Пресвятой Богородицы.

Свт. Нифонт отвечал новгородцу Кирику, что если человек только на смертном одре покается, то, «аще и вельми грешен есть, причащение дай ему».

Свт. Нифонт отвечал священнику Савве, что причащение родильнице при угрожающем её жизни состоянии можно давать и в день родов, и позднее.

Говоря о новгородцах, обращавшихся за молитвой не к православному священнику, а «к варяжскому», свт. Нифонт замечал, что они «аки двоеверцы суть».

Сохранившееся поучение свт. Иоанна-Илии от 13 марта 1166 года обращено к новгородским священникам, как это видно из текста поучения (статьи 1, 2, 4, 5 и др.) (См.: Поучение Новгородского архиепископа Илии (Иоанна).)

Ответ по данному вопросу свт. Нифонта см.: Вопросы Кирика, Саввы и Илии с ответами Нифонта, епископа новгородского и других иерархических лиц. Вопрос Кирика 63.
Согласное с решением свт. Нифонта высказывание свт. Иоанна-Илии и его добавление – см.: Поучение Новгородского архиепископа Илии (Иоанна). Статья 6.

Из ответов свт. Нифонта здесь приведены ответы на вопросы Кирика 85, 91 (Вопросы Кирика, Саввы и Илии с ответами Нифонта, епископа новгородского и других иерархических лиц.) Из Поучения свт. Иоанна-Илии приведены статьи 7, 9, 10. (Поучение Новгородского архиепископа Илии (Иоанна).)

Древнерусскому слову «куны» соответствует современное «деньги».

О существовании богадельни при Новгородской Софии свидетельствуют слова свт. Иоанна-Илии: «Святая София не убога есть, да мочно ми есть и в церковь ввести, и хлеба даяти». (Поучение Новгородского архиепископа Илии (Иоанна). Статья 14 (прим. 3728).)
По церковному Уставу кн. Владимира к церковным и богадельным людям, получавшим призрение в богадельнях, относятся все перечисленные люди, кроме зависимых людей. (См., напр.: Бердников И.С. Краткий курс церковного права Православной Церкви. Устав князя Владимира.)

В XII-XIII вв. каменные храмы в Новгороде строились быстро – в течение трёх летних месяцев; столько именно времени ушло и на постройку церкви Благовещения на Мячине.

Свт. Нифонт не признавал Климента Смолятича митрополитом Киевским, т.к. митр. Климент не получил благословения на занятие Киевской кафедры от Константинопольского патриарха.

Из перечисленных кафедр во время Собора 1147 года ещё не были учреждены Коломенская и Тверская кафедры. (См., напр.: Соловьёв С.М. История России с древнейших времён. Т. 3. Гл. 1. Столб. 727 (прим. 2).)
Епископы остальных из перечисленных кафедр участвовали в данном Соборе. (См., напр.: Житие преподобного отца нашего Нифонта, епископа Новгородского.)

Об изгнании свт. Иоанна-Илии новгородцами по наущению дьявола и о вразумлении их чудом Божиим см., напр., в житии святителя: Житие святого отца нашего Иоанна, архиепископа Новгородского.

Икона Богоматери «Знамение», в честь которой свт. Иоанн-Илия установил празднование 27 ноября, первоначально находилась в храме святого Спаса на Ильине улице в Новгороде. См., напр.: Житие святого отца нашего Иоанна, архиепископа Новгородского.
В XIV веке в Новгороде специально для иконы Богоматери была построена каменная церковь Знамения Пресвятой Богородицы. См., напр., краткое повествование об иконе Знамения Пресвятой Богородицы: Минея. Ноябрь. – М., 2002. В 27 день.
После возвращения из Новгородского музея-заповедника икона «Знамение» в настоящее время находится в Новгородском Софийском соборе. (См., напр.: Губарева О.В. Божия Матерь в Её иконах.)

В 1439 году были обретены мощи свт. Иоанна-Илии, при этом Новгородскому архиепископу было открыто имя святителя Иоанна. В результате святителю Иоанну было установлено местное празднование. См. об этом: Мануил (Лемешевский), митр. Иоанн, святитель, архиепископ Новгородский и Псковский (Иван, в малой схиме Илия, в схиме Иоанн).
Также см. краткое житие святителя Иоанна, архиепископа Новгородского: Минея. Сентябрь. – М., 2002. В 7 день.